:::回首頁English網站導覽常見問答聯絡我們舊版www  
本院簡介 研究單位 技術移轉 研究資源 圖書館 訊息公告 院內網站
 
::: 首頁>研究單位> 群體健康科學研究所>研究資源
*
單位簡介
研究宗旨
研究主題
研究成果
研究資源
研究成員
同仁名錄
單位聯絡
*
* * *
*
 
群體健康科學研究所
  
研究資源

 

高通量技術發展快速且應用日廣,使得生命科學研究對生物資訊技術的需求日增,我們特以前瞻技術及資源分工的架構,成立「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」(Bioinformatics Core Facility for Translational Medicine and Biotechnology Development, 簡稱TMBD 生物資訊核心設施 ),提供全國生物資訊服務。

本核心整合了國家衛生研究院、國立交通大學、國立清華大學、國立成功大學,以及中央研究院等五所機構的生物資訊團隊,專業領域涵蓋功能基因體及轉譯醫學、轉錄體學及宏觀基因體學、癌症基因體學及臨床研究、應用基因體醫學、結構蛋白質體學及藥物應用、生醫文獻探勘及生物標記探索等,能滿足多樣的生物資訊需求。本核心的服務據點涵蓋北中南由總計畫國家衛生研究院設立協調中心,統籌服務管理與教育訓練。子計畫以專業分工,開發新穎工具與資料庫,提供線上服務;並在協調中心的統籌下依使用者需求組成團隊,以客戶為中心(Client-centric),透過與高通量實驗之核心和產業界合作,提供研究人員生物資訊各領域從研究設計、實驗轉介、資料前處理、資料分析到生物意義闡釋的一站式完整客製化資料分析服務。

1. Sequences Assembly and Metabolic Network Reconstruction Tools

  • Metabolic network reconstructions for Bacteria

http://sb.nhri.org.tw/MrBac/

  • Contig Integrator for Sequence Assembly of Bacterial Genomes
    整合各種不同組裝工具所產出的序列,找出相互吻合的序列片段,最後提供一組整合後的基因體序列。

http://sb.nhri.org.tw/CISA/

     

  •  A software platform for GEnome-scale Metabolic model Simulation, Reconstruction and Visualization
    開發可針對全基因體的代謝網絡模型進行模擬、重建與及圖形化介面的呈現的軟體平台GEMSiRV。

http://sb.nhri.org.tw/GEMSiRV

2. Database of Protein Interactomes

  • Fly-DPI: Database of Protein Interactomes for D. melanogaster in the Approach of Systems Biology
    蛋白質交互作用網路,提供單一蛋白質廣泛搜尋及專一性蛋白質對交互作用搜尋。

http://flydpi.nhri.org.tw

  • Helicobacter pylori- Database of Protein Interactome (hp-DPI)
    蛋白質預測交互作用系統,可以協助研究社群找出未知蛋白質的功能與其可能參與的角色

http://dpi.nhri.org.tw/hp/

  • Spotlight: assembly of protein complexes by integrating graph clustering methods
    整合多種網路拓樸演算法之特點,可快速解析複雜網路中所隱喻的蛋白質複合體,並預測分析其可能參與的代謝路徑與調控功能。

http://hub.iis.sinica.edu.tw/spotlight/

  • Hubba 複雜網路樞紐分析器: A Framework of Interactome Hubs Identification for Network Biology

http://hub.iis.sinica.edu.tw/Hubba

 

3. Biomedical Resources on Viruses

  • Fluctrl人類A型流感之抗原演化監測系統
    依據病毒株發現的地點及年份加以分類,並針對HA序列片段上每個位點的胺基酸,分析得出每一年份在特定位點上的代表胺基酸。

http://sb.nhri.org.tw/fluctrl

  • ICES: Identification of cytotoxic T lymphocyte epitopes for swine viruses
    提供國人疫苗研發設計使用

http://sb.nhri.org.tw/ICES

  • ATIVS: analytical tool for influenza virus surveillance
    用來分析血清學數據以及利用流感病毒的表面抗原–紅血球凝集素 HA (hemagglutinin) 來預測病毒的抗原性

 http://influenza.nhri.org.tw/ATIVS/

 4. Primer and Probe Design Tools

  • PDA:Primer Design Assistant
    線上核酸引子設計工具,容許一次單筆或多筆核酸序列資料同時進行線上最佳化分析,均一化所需批次進行的PCR反應條件

 http://dbb.nhri.org.tw/primer/

  • UPS 2.0: Unique Probe Selector for Probe Design and Oligonucleotide Microarrays in Pangenomic/ Genomic Level
    高專一度的線上探針設計工具,所設計的探針可提高泛基因體(pangenomic)與基因體(genomic)內的雜交專一性。

 http://array.iis.sinica.edu.tw/ups/

 5. Phylogenetic Analysis Tools

  • POWER: PhylOgenetic WEb Repeater
    可反覆執行之序列親緣關係分析工具 : 提供一般序列(Fasta)與比對序列(Aligned sequences) 二種方法來進行核酸或蛋白質序列親緣關係分析,並可即時動態增加或減少序列數目節點。

http://power.nhri.org.tw/ 

  • PALM: Phylogenetic Reconstruction by Automatic Likelihood Model Selector
    最佳化分子親緣關係分析平台
    自動選擇最佳演化模型之生物分子親緣關係分析平台

http://palm.iis.sinica.edu.tw/

 

 

『國民健康訪問調查』資料管理系統(NHIS Information System, NHISIS),系統分為兩個區塊:其一為題庫式動態問卷調查資料管理系統,主要的作用在於協助完成NHIS之各項作業,包括選取樣本、設計問卷、建立資料庫、資料檔的分割與管理等,本系統為一具有彈性的問卷調查資料管理平台,除了供NHIS的應用外,同時也適用於其他的問卷調查研究上;另一區塊為NHIS網頁(http://nhis.nhri.org.tw)其除將NHIS的相關資訊藉由網際網路提供給外界外,同時也是做線上資料申請與下載的平台。

 

國家攝食資料庫係依據風險評估曝露原則所需及發展而建立。利用國民營養健康狀況變遷調查所提供之數據,資料庫除建立風險評估暴露所需之食品分類外,亦依此食品分類提供國人(依年齡、性別)對各種食品之攝食量數據,此攝食量數據為進行攝食暴露評估時的根本依據。民眾及專家學者可於國家攝食資料庫網站上查詢資料庫之相關內容。

 

兒童及青少年行為之長期發展(Child and Adolescent Behaviors in Long-term Evolution,簡稱CABLE)計畫,為國家衛生研究院自2001年開始執行至今的長期追蹤計畫。立意選取台北市及新竹縣,在兩地公立小學中隨機抽出1所大型學校、2所中型學校及6所小型學校,共18所學校樣本,以各校之一年級(第一世代)和四年級(第二世代)全體學生為個人樣本,在取得同意後,逐年以問卷調查方式收集學生資料。研究目的為:1.觀察學童的健康行為、健康狀況、心理健康和生活型態的改變;2.探討與學童健康行為和身心健康狀況之變化有關的因素;3.區分學童在健康行為和身心健康變化上不同的發展趨勢類型。研究結果可對學童的健康行為與健康狀況之變化趨勢及其相關因素提出實證依據,並可對健康介入計畫的設計有所貢獻,且可提供政策制訂者與學童健康有關的資訊。於CABLE網頁中,介紹了計畫之研究目的、抽樣方法、研究方法、研究工具及研究團隊等內容,並整理有CABLE歷年來所發表的學術論文、碩博士論文摘要,簡述研究成果的CABLE News,每年出版的年報的館藏地。透過網頁,讓對此研究有興趣的研究人員及師長等,更瞭解研究的設計與主題,並可分享研究之成果。

 

為積極推展國內臨床試驗之研究與發展,參與臨床研究計畫之設計、執行及分析等相關作業,建立「臨床試驗資料管理系統」(Clinical Trial Information Management System,簡稱CTIMeS),有效管理多中心臨床試驗龐大且複雜之資料,確保資料之品質。服務範圍涵蓋國內外合作對象,目前已服務臨床試驗計劃已達33個,全國相關參與醫院也有79家之多。

 

2015/07/30 updated

*
* * *
     
  私隱政策與免責聲明 | 財團法人國家衛生研究院版權所有
苗栗縣竹南鎮 35053 科研路35號 -- 電話: +886-37-246-166 begin_of_the_skype_highlighting              +886-37-246-166      end_of_the_skype_highlighting
台北市南港區 11503 園區街3號10樓(南港軟體園區F棟) -- 電話: +886-2-2653-4401 begin_of_the_skype_highlighting              +886-2-2653-4401      end_of_the_skype_highlighting
電子信箱:webmaster@nhri.org.tw